Внутри Перу также существует разветвлённая сеть внутренних авиалиний, однако самый дешёвый вид транспорта для путешествия по стране - поезд. Ездить на поездах лучше всего в первом классе, другие вагоны не очень комфортабельны. Знакомиться со страной можно и из окна автобуса, тем более, что здесь проходит несколько важных магистралей Южной Америки. Это 2500-километровый отрезок Панамериканского шоссе, которое пересекает территорию Перу вдоль побережья с севера на юг, и Трансандское шоссе, которое до сих пор остается единственной магистралью, напрямую связывающей восточное и западное Перу. В районе сельвы, где практически нет дорог, распространены перевозки на своеобразных водных такси - лодках-каноэ и моторных катерах.
Внутри городов лучше передвигаться на автобусах и маршрутных такси. Надо заметить, что расписания автобусов здесь нет. Такси также удобны, только об оплате следует договариваться сразу, потому что таксисты часто завышают цену.
Для того, чтобы взять машину напрокат, необходимо иметь водительские права международного образца, кредитную карту и быть старше 23 лет.