Андижан - один из древнейших городов Ферганской долины. В Андижане родился Захриддин Бабур - военачальник, государственный деятель и потомок Тимура, который завоевал Индию и в 16 веке основал Империю Великих Моголов. В 1902 году Андижан пострадал от сильного землетрясения, и город был фактически построен заново.
Среди исторических памятников сохранилась лишь медресе Джами.
В окрестностях Андижана находятся остатки городища Мархамат - столицы древнего государства Давань, а также остатки древнего города Кува, где можно увидеть руины построек 3 века до н.э и буддийского храма 6-8 веков н. э.