На островах Микронезии преобладает тропический морской тип климата. Температура мало меняется от сезона к сезону. Дневная температура держится круглый год около отметки +30 градусов, а ночная - около +23 градусов. Климат Федеративных Штатов Микронезии отличается большой влажностью.
Наибольшее количество осадков выпадает на восточных островах. Остров Понпеи считается одним из самых влажных мест на Земле, здесь за год может выпадать до 8400 мм осадков. В среднем на островах отмечается от 3000 до 6000 мм осадков в год. Максимальное количество осадков приходится на период с апреля по декабрь, когда преобладают влажные юго-западные муссоны, сухой сезон приходит с устойчивыми северо-восточными пассатами в январе и продолжается до марта. Часть Тихого океана, где находятся Федеративные Штаты Микронезии, является областью зарождения тайфунов. Тайфуны наблюдаются в период дождей и приносят с собой штормовую погоду с ураганными ветрами. В это время множество атоллов затапливается.
