Климат в стране субтропический. Северные районы и побережье Средиземного моря имеют субтропический средиземноморский тип климата с прохладными дождливыми зимами и жарким сухим летом. Наиболее комфортные условия наблюдаются в районе Иерусалима. Самым жарким месяцем является август - дневные температуры достигают +29 градусов, ночью же отмечается около 20 градусов тепла. Осадков в летнее время практически не выпадает. Наибольшее количество осадков отмечается в зимнее время, самый дождливый месяц - январь (133 мм). Всего за год здесь выпадает до 1000 мм осадков. Зимой в возвышенных районах температура воздуха опускается ниже 0 градусов, а гора Хермон покрыта снегом с декабря по март. На юге Израиля летом температура воздуха в дневные часы поднимается до +40 градусов, ночью тоже достаточно жарко - около 26 градусов тепла. Зимой воздух прогревается до +21..+23 градусов, ночью охлаждается до +10..+12 градусов. Самая засушливая территория Израиля - пустыня Негев, где среднегодовая сумма осадков составляет всего лишь 20 мм.
Температура воды Мертвого моря колеблется от +19 градусов в феврале до +31 градуса в августе, Средиземного моря - от+18 до +28 градусов, Красного моря - от +22 до +27 градусов.