В целом климат Филиппин тропический, муссонный, но благодаря сильной расчлененности рельефа, он неоднороден.
Температура воздуха на Филиппинских островах стабильна круглый год. Разница между самым жарким и самым прохладным месяцами на севере 4o С, а на юге еще меньше. Средняя годовая температура на равнинах около 27o С.
По количеству и сезонному распределению осадков выделяют четыре области:
1. В восточных районах Филиппинского архипелага (восточное побережье Лусона, Бохоля и Лейте, центральная и западная части Минданао и архипелаг Сулу) осадки выпадают равномерно в течение всего года.
2. В западных районах страны (на западе островов Лусон, Миндоро, Панай, Палаван, Негрос) выделяют два сезона: зимне-весенний сухой - 50-200 мм осадков (октябрь - апрель) и летне-осенний влажный (с апреля по октябрь идут интенсивные дожди, вызываемые сильными юго-западными ветрами).
3. На северо-востоке Лусона, о.Самар, востоке островов Лейте и Минданао осадки выпадают круглый год, но их максимум приходится на ноябрь - январь. В летние и осенние месяцы с востока и северо-востока на Лусон и Висайские о-ва периодически обрушиваются тайфуны. С продолжительными ливневыми дождями связаны катастрофические паводки. Годовое количество осадков в этой области 2000-4000 мм.
4. Область, включающая восточные районы островов Миндоро, Панай, Негрос, Себу и северо-запад о.Минандао, характеризуется среднегодовым количеством осадков 1300-1500 мм и непродолжительным относительно сухим периодом.