Кения расположена в Восточной Африке по обе стороны от экватора. На юге она граничит с Танзанией, на западе - с Угандой, на северо-западе - с Суданом, на севере - с Эфиопией, на северо-востоке - с Сомали, на юго-востоке омывается водами Индийского океана. Площадь страны - 580 тыс. кв. км.
У побережья Индийского океана протянулись прибрежные равнины, которые уходят вглубь материка в северо-восточной части страны и переходят в засушливое плоскогорье. Западную часть страны пересекает Восточно-Африканская рифтовая долина, в которой лежит озеро Рудольф (озеро Туркана). По обе стороны от Рифтовой долины возвышается Центральное нагорье со средними высотами до 3000 м, где расположены самые высокие точки страны - горы Кения (5199 м) (вторая по высоте точка Африки) и Элгон (4321 м). Нагорье ступенчато понижается к западу и востоку.
На юго-западе страны расположена часть озера Виктория. Виктория - самое большое озеро Африканского континента и второе по величине пресноводное озеро на Земле. Площадь его - 68 тысяч кв. км. Кения вместе с Танзанией и Угандой делит озеро Виктория на 3 части. Кении принадлежит самая малая из этих частей площадью 3785 кв. км.
Главные реки страны - Тана и Галана, которые впадают в Индийский океан, а также Нзоя, Яла, Мара и Гори, которые впадают в озеро Виктория.