В стране хорошо развита сеть местных авиалиний. Всего здесь более 200 аэропортов и небольших частных аэродромов, которые обслуживают малую авиацию. Небольшими чартерными рейсами чаще всего пользуются туристы, которые хотят попасть в Национальные парки. Между городами Кении быстрее всего передвигаться на мини-автобусах, которые называются здесь "мататас". Они отправляются по мере заполнения. Эти автобусы не очень надёжны, потому что принадлежат частным компаниям, и не очень комфортабельны. Между крупными городами Кении также курсируют современные экспресс-автобусы, билеты на которые стоят дороже, чем на мини-автобусы. Железнодорожный транспорт в стране развит слабо, он связывает самые крупные города Кении, но, в основном, добраться до наиболее популярных туристических достопримечательностей на поезде невозможно. На побережье и на озёрах развито паромное сообщение. Кроме того, здесь можно нанять парусную лодку "доу", которая доставит вас до необходимого пункта.
В городах Найроби и Момбаса внутреннее сообщение представлено разветвлённой сетью автобусных маршрутов. В других городах передвигаться лучше всего на такси. Однако, о цене надо договариваться заранее и стараться вызывать машину по телефону из отеля.
Многие туристы предпочитают путешествовать на собственном автомобиле, особенно по Национальным паркам. Для того, чтобы арендовать автомобиль, необходимо быть старше 23 лет, иметь водительские права международного образца, кредитную карту и стаж вождения более 2 лет. Надо заметить, что путешествовать одним в Кении не безопасно, поэтому обязательно нанимайте гида.